Pokémon Shinies possuem uma coloração diferenciada dos outros
Pokémon. Eles são um pouco mais raros, suas únicas diferenças dos
Pokémon normais é a cor, além de brilharem ao saírem da Pokébola.
Noctowl: ele apareceu em Johto, foi capturado por Ash com a ajuda de Pikachu. Ele substituiu o velho Pidgeotto e ajudou em várias batalhas, como na do ginásio de Morty. Depois que Ash foi para Hoenn, o Noctowl ficou com o profº Carvalho e foi substituído pelo Swellow. Foi o primeiro pokémon shiny que apareceu no anime.
Shuckle: esse Shuckle tem um casco azul. Um velho em Johto extraia o suco desse Shuckle para fazer uma espécie de poção do amor que serve para atrair pokémon. Sabendo disso, Jessie, James e Meowth resolveram roubá-la, mas com ajuda do velho, Ash e os outros, tudo volta ao normal.
Gyarados: o Shiny mais conhecido, ele até aparece de brinde no jogo para capturar. Ele tem coloração vermelha. A Equipe Rocket de Johto forçavam pokémons a evoluir com uma máquina, este era um Magikarp comum que virou Shiny durante sua evolução. Causou confusão com sua fúria, mas com ajuda de Pryce, Ash e os outros, e de Lance da elite 4, resolveram o problema.
Magneton: este pokémon pertence a Jackson (ou Vicent), que usa numa batalha contra Ash na Liga Johto. Ash acaba empatando nesta luta mas mesmo assim, se classificou para a próxima etapa da liga. Foi o Shiny com a aparição mais curta no anime.
Swellow: caracterizado pelo tom de cor verde. Ele pertence a Winona, a líder de pokémons voadores do ginásio da Cidade de Fortree, na região de Hoenn. Ela utilizou este Swellow numa batalha contra Ash pela insígnia, que por sua vez, também usou seu Swellow para derrotá-la.
Magikarp: um Magikarp dourado que aparece em Hoenn. Um treinador que possuia um Ivysaur e um Wartotle pescou este Magikarp. Então chegou um outro treinador interessado e resolveu trocar o seu Charmeleon pelo o Magikarp, fazendo ele ficar com as 3 evoluções dos iniciais de Kanto.
Donphan: também aparece em Hoenn. Esta Donphan shiny é fêmea. Ela foi um destaque em meio de outros Donphans normais. Ela fazia com que os outros Donphans caíssem de amor por ela, que usavam golpes de rolo compressor para impressioná-la.
Dustox: já na região de Sinnoh, o Dustox de Jessie encontra um Dustox shiny que pertencia a um treinador. Eles se apaixonaram e ambos libertam seus pokémons para procriarem. Jessie amarra umas fitas nas antenas de Dustox e os Dustoxs partem para uma vida juntos. Semelhante ao do Butterfree de Ash.