A Captura de Pokémon é a maneira de conseguir um Pokémon. Dependendo o Pokémon é um jeito difícil de conseguir. Pokémon Raros são bem mais difíceis de Capturar que os outros. Para capturar um Pokémon você deve ter uma Pokébola, que é um item que guardará seu Pokémon. Existem diversos tipos de Pokébola, então o treinador escolhe qual é o melhor tipo para capturar o Pokémon que ele quer. Cada Poké-bola além das comuns tem uma vantagem sobre um determinado tipo ou condição.
Em seguida você deve entrar em uma batalha contra um Pokémon Selvagem, lembrando que os Pokémon raros tendem a aparecer a partir da quinta geração nos matinhos que se sacodem. Se o Pokémon que apareceu for de seu interesse e você quer capturá-lo, deve ter cuidado. Durante a batalha você deve enfraquecer o Pokémon até o mínimo possível de seu HP antes dele desmaiar, existem também outros fatores que contribuem, para aumento das chances de captura, a paralisia e fazer o Pokémon dormir. Quando isso acontecer e você achar que é a hora certa, lance uma Pokébola e espere para ver se conseguiu, pois as vezes os Pokémon podem não entrar nela. Se isso acontecer o treinador deve tentar de novo, até conseguir. Para os Pokémon Raros em geral devemos usar Pokébolas Especiais, como as Ultraball e as Duskball. Lembre-se de que se um Pokémon não entrar em sua Pokébola, você não a terá de volta.
No Anime, como muitas coisas são diferentes dos Jogos, para capturar um Pokémon também é diferente. O treinador entra em uma batalha contra um Pokémon e na maioria das vezes deve ganhar por completo, até ele desmaiar, e depois lançar a Pokébola. Se isso chegar a acontecer no Jogo, você perde o Pokémon. Outra maneira de conseguir um Pokémon é fazendo amizade com ele, se isso acontecer talvez nem precise batalhar.
Um novo método criado na 3ª Geração foram as batalhas duplas. Existem dois tipos de batalhas em duplas: aquela em que são dois treinadores usando dois Pokémon cada e aquela onde são 4 treinadores usando um Pokémon cada, sendo 2x2. Quando é uma batalha contra Pokémon Selvagem em dupla, como na 4ª Geração em diante, você pode capturar apenas um Pokémon a cada batalha, pois há impossibilidade de captura com dois Pokémon em batalha, portanto primeiro vença qual você não quer.
Na quinta geração também temos as batalhas triplas e rotatórias, mas nelas não se pode capturar Pokémon. Cada Pokémon tem sua própria chance de captura, e isso varia de acordo com cada Pokémon.